El Juvenil Instituto Fueguino tiene como misión preparar a sus alumnos para ser ciudadanos libres, seguros de sí mismos, conscientes de sus propias capacidades, reflexivos y participativos, mediante una propuesta de educación integral, basada en la equidad de oportunidades, el respeto por la diversidad y en valores trascendentales, que les permitan insertarse sin dificultades, no solo en los niveles de estudios superiores, sino por sobre todo en la sociedad en la que se desenvuelven.